| 一线、企业创新活跃；国际合作继续突破；中青年、归国人才担纲 |
据国家科学技术奖励工作办公室介绍，在本届评奖过程中，奖励办就评选方法进行了改革，获奖项目呈现出一些新特征。
奖励项目的评选方法主要对推荐书进行了改革。不仅限制了主体内容的填写页数，最重要的是要求阐述项目的科学发现，包括技术发明、科技创新、第三方评价和应用情况。同时，在推荐书中增加了“推荐单位声明”，要求推荐单位作出承诺，严格按照有关规定和要求，认真履行推荐单位义务并承担相应责任。
为了推动交叉新兴学科的发展，奖励办增设了“铁路运输专业评审组”、组建了“非金属材料专业评审组”，进一步减小网络评审的学科专业跨度，加大同行专家评审力度。
奖励办制定了企业技术创新工程项目的评价指标。根据各奖项的特点，重新制定了国家自然科学奖、国家技术发明奖以及国家科技进步奖的技术开发类、社会公益类、重大工程类、国家安全类项目的评价指标。
2009年度三大奖获奖成果及完成人主要有以下几个突出特点。
第一，激励一线科技人员创新，推动全民参与创新活动。今年有2位一线工人和2位农民获得国家科技奖励。他们分别是宝山钢铁股份有限公司的王康健、江苏省电力公司泰州供电公司的许杏桃，天津富康农业开发有限公司的郭玉富、河南平安种业有限公司的吕平安。
第二，大力推进国际科技交流与合作。2009年国际科技合作奖7人，为历年最多。他们分别是美国的沈元壤，德国的爱斯特·路德维希·温奈克，法国的石·米歇尔，美国的文森特·陈，日本的有马朗人，古巴的奥古斯汀·拉赫·戴维拉和美国的布立顿·强斯。
第三，年轻人才和留学归国人才进一步发挥重要作用。数据显示，中青年人才和海外归国人才成为科技创新的重要力量，在国家自然科学奖、技术发明奖、科技进步奖三大奖完成人中，45岁以下的比例达到58.3%；在国家自然科学奖第一完成人中，留学归国人员比例达到60.7%。比如，“非线性偏微分方程的自适应与多尺度计算方法”成果获国家自然科学奖二等奖，陈志明研究员是成果的第一完成人，他于1992年在德国获博士学位，1997年10月被聘任为中国科学院数学研究所研究员，现任中国科学院计算数学与科学工程计算研究所所长、科学与工程计算国家重点实验室主任。“拓扑异构酶II新型抑制剂沙尔威辛的抗肿瘤分子机制”成果获国家自然科学奖二等奖，丁健研究员是第一完成人，他于1991年获日本九州大学医学博士学位，现任中国科学院上海药物研究所所长、国家新药研究重点实验室主任。“大气颗粒物及其前体物排放与复合污染特征”成果获国家自然科学奖二等奖，郝吉明院士是第二完成人，他于1984年毕业于美国辛辛那提大学，获博士学位，经过20年的系统研究，在酸雨控制规划方面取得的成果，为确定我国酸雨防治对策起了主导作用。
并且，在2009年度国家科技奖获奖目录上，有7家创新型企业获得奖励。科技进步奖通用项目中，企业参与完成的项目占68.0%；纺织、化工、装备业等领域的技术水平和国际竞争力显著提高；中小型科技企业创新能力进一步增强，参与完成项目的比例达到27.1%。
